اوراسیل و تیمین

Wight

New Member
ارسال ها
1,188
لایک ها
888
امتیاز
0
#1
سوال : چرا در dna به جای u باز t وجود دارد و همچنین چرا در rna ....

لطفا دلیل تکاملی و بیوشیمیایی ... !
 

Ardavan

Well-Known Member
ارسال ها
914
لایک ها
428
امتیاز
63
#2
پاسخ : اوراسیل و تیمین

سوال : چرا در dna به جای u باز t وجود دارد و همچنین چرا در rna ....

لطفا دلیل تکاملی و بیوشیمیایی ... !
دلیل بیوشیمیایی : وجود t در rna پیوند فسفودی را ناپایدار می کنه ( چرا؟) - و این که وجود t در dna احتمال جهش را در dna کاهش می ده ( چرا؟)
دلیل تکاملی : دلیل بیوشمیایی های بالا خود می توانند یک دلیل تکاملی هم باشند (چرا؟)

دوست من یکم روی این چراها فکر کنید . اگر علت را متوجه نشدید دقیق تر توضیح بدم !
 

Wight

New Member
ارسال ها
1,188
لایک ها
888
امتیاز
0
#3
پاسخ : اوراسیل و تیمین

دلیل بیوشیمیایی : وجود t در rna پیوند فسفودی را ناپایدار می کنه ( چرا؟) - و این که وجود t در dna احتمال جهش را در dna کاهش می ده ( چرا؟)
دلیل تکاملی : دلیل بیوشمیایی های بالا خود می توانند یک دلیل تکاملی هم باشند (چرا؟)

دوست من یکم روی این چراها فکر کنید . اگر علت را متوجه نشدید دقیق تر توضیح بدم !
می شه توضیح بدید
 

Ardavan

Well-Known Member
ارسال ها
914
لایک ها
428
امتیاز
63
#4
پاسخ : اوراسیل و تیمین

بذارید دوستان دیگر هم فکر کنند تا مباحثه ما ! جذاب تر بشه . اگر کسی نظری نداشت جواب را من خودم بعدا می نویسم ! (خیلی هم سخت نیست!)
 

masoud.77

New Member
ارسال ها
35
لایک ها
37
امتیاز
0
#5
پاسخ : اوراسیل و تیمین

مطمینم که دلیل تو هیچ سوالی نمی یاد فقط اینا حفظ کن (هر باز دو حلقه ای با یک باز تک حلقه ای جفت می شه چه تو ma و چه توی dna)
 

Ardavan

Well-Known Member
ارسال ها
914
لایک ها
428
امتیاز
63
#6
پاسخ : اوراسیل و تیمین

مطمینم که دلیل تو هیچ سوالی نمی یاد فقط اینا حفظ کن (هر باز دو حلقه ای با یک باز تک حلقه ای جفت می شه چه تو ma و چه توی dna)
بله ؟؟ حالا درسته المپیاد به سمت حفظی شدن رفته ولی نه دیگه ان قدر که 100 درصد حفظی باشه !! بعدش هم جواب شما کاملا نامرتبط بود و کاملا غلط ! اصلا ربطی نداره !
 

Wight

New Member
ارسال ها
1,188
لایک ها
888
امتیاز
0
#7
پاسخ : اوراسیل و تیمین

بله ؟؟ حالا درسته المپیاد به سمت حفظی شدن رفته ولی نه دیگه ان قدر که 100 درصد حفظی باشه !! بعدش هم جواب شما کاملا نامرتبط بود و کاملا غلط ! اصلا ربطی نداره !
به گروه متیل ربط داره و نحوه رونویسی ...

با توجه به ساختارشون فقط اون ch2 بیشتر داره. اما با توجه به جفت شدن A با T این Ch2 ربطی به جفت شدن نداره!
 
آخرین ویرایش توسط مدیر

reyhane

New Member
ارسال ها
121
لایک ها
76
امتیاز
0
#8
پاسخ : اوراسیل و تیمین

سوال : چرا در dna به جای u باز t وجود دارد و همچنین چرا در rna ....

لطفا دلیل تکاملی و بیوشیمیایی ... !
من فک کنم واس این کاهش میده که، اگه سیتوزین دامینه بشه میشه یوراسیل خوب اگه قرار باشه جای تیمین هم یوراسیل باشه سیستم ترمیمی خارجی برای برداشت یوراسیل های خارجی دچار مشکل میشه. و امکان تشخیص براش کم میشه.خب این خودش باعث ایجاد جهش های بیشتری میشه،نسبت به وقتی که ما تیمین داریم.
اگه که یوراسیل بود، رفته رفته میزان پیوند بین باز های سیتوزین و گوانین کم میشد.اگه این هی ادامه پیدا میکرد g=c (منظورم پیوند بین اوناس!درسته که سه تا پیوند هیدروژنیه!)
به طور کلی از دی ان ای ها حذف میشد.پس تکامل تیمین رو به جا یوراسیل قبول کرده!
 

Ardavan

Well-Known Member
ارسال ها
914
لایک ها
428
امتیاز
63
#9
پاسخ : اوراسیل و تیمین

به گروه متیل ربط داره و نحوه رونویسی ...

با توجه به ساختارشون فقط اون ch2 بیشتر داره. اما با توجه به جفت شدن A با T این Ch2 ربطی به جفت شدن نداره!
اره دلیل چرای اول مرتبط با همین ساختارهاست (گروه متیل) ! البته کتاب genes که من این مطلب را خوندم فقط همون جمله من را نوشته و دلیل نیاورده ولی دلیلش همینه !
در واقع این گروه متیل تعامل میان بازها را در rna از نظر انرژیتیک غیر مساعد می کند .....
کلا این مسئله هم ربطی به base-pairing نداشت !
این جواب چرای اول !
 

reyhane

New Member
ارسال ها
121
لایک ها
76
امتیاز
0
#10
پاسخ : اوراسیل و تیمین

دلیل بیوشیمیایی : وجود t در rna پیوند فسفودی را ناپایدار می کنه ( چرا؟) - و این که وجود t در dna احتمال جهش را در dna کاهش می ده ( چرا؟)
دلیل تکاملی : دلیل بیوشمیایی های بالا خود می توانند یک دلیل تکاملی هم باشند (چرا؟)

دوست من یکم روی این چراها فکر کنید . اگر علت را متوجه نشدید دقیق تر توضیح بدم !
من فک کنم واس این کاهش میده که، اگه سیتوزین دامینه بشه میشه یوراسیل خوب اگه قرار باشه جای تیمین هم یوراسیل باشه سیستم ترمیمی خارجی برای برداشت یوراسیل های خارجی دچار مشکل میشه. و امکان تشخیص براش کم میشه.خب این خودش باعث ایجاد جهش های بیشتری میشه،نسبت به وقتی که ما تیمین داریم.
اگه که یوراسیل بود، رفته رفته میزان پیوند بین باز های سیتوزین و گوانین کم میشد.اگه این هی ادامه پیدا میکرد g=c (منظورم پیوند بین اوناس!درسته که سه تا پیوند هیدروژنیه!)
به طور کلی از دی ان ای ها حذف میشد.پس تکامل تیمین رو به جا یوراسیل قبول کرده!
 

Ardavan

Well-Known Member
ارسال ها
914
لایک ها
428
امتیاز
63
#11
پاسخ : اوراسیل و تیمین

من فک کنم واس این کاهش میده که، اگه سیتوزین دامینه بشه میشه یوراسیل خوب اگه قرار باشه جای تیمین هم یوراسیل باشه سیستم ترمیمی خارجی برای برداشت یوراسیل های خارجی دچار مشکل میشه. و امکان تشخیص براش کم میشه.خب این خودش باعث ایجاد جهش های بیشتری میشه،نسبت به وقتی که ما تیمین داریم.
اگه که یوراسیل بود، رفته رفته میزان پیوند بین باز های سیتوزین و گوانین کم میشد.اگه این هی ادامه پیدا میکرد g=c (منظورم پیوند بین اوناس!درسته که سه تا پیوند هیدروژنیه!)
به طور کلی از دی ان ای ها حذف میشد.پس تکامل تیمین رو به جا یوراسیل قبول کرده!
الان این پاسخ یک ایرادی که داره و من همیشه اون را این طور جواب می دم اینه :
با امدن t در dna احتمال این نوع جهش دامیناسیون کم می شه اما بالعکس احتمال جهش های دیمر پیرییدینی افزایش می یابد . ( t بیش از سایر بازها تمایل به تشکیل دیمر در حضور پرتوفرابنفش دارد ) . حالا چه توضیحی می تواند توجیه کند که احتمال جهش با امدن t در dna پایین تر می اید ؟
 
آخرین ویرایش توسط مدیر

Wight

New Member
ارسال ها
1,188
لایک ها
888
امتیاز
0
#12
پاسخ : اوراسیل و تیمین

اره دلیل چرای اول مرتبط با همین ساختارهاست (گروه متیل) ! البته کتاب genes که من این مطلب را خوندم فقط همون جمله من را نوشته و دلیل نیاورده ولی دلیلش همینه !
در واقع این گروه متیل تعامل میان بازها را در rna از نظر انرژیتیک غیر مساعد می کند .....
کلا این مسئله هم ربطی به base-pairing نداشت !
این جواب چرای اول !
باز هم باتوجه به ساختار

اون گروه متیل باعث ایجاد یک پیوند هیدروژنی می شه و جفت شدن باز ها را تقویت می کند.

دلیل تکاملی هم که ....
 

Ardavan

Well-Known Member
ارسال ها
914
لایک ها
428
امتیاز
63
#13
پاسخ : اوراسیل و تیمین

باز هم باتوجه به ساختار

اون گروه متیل باعث ایجاد یک پیوند هیدروژنی می شه و جفت شدن باز ها را تقویت می کند.

دلیل تکاملی هم که ....
گروه متیل پیوند هیدروژنی می دهد ؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟ نه خیر من این توضیح را برای این جمله گفتم که چرا وجود t پیوند فسفودی استر را در rna ناپایدار می کند !
 

Wight

New Member
ارسال ها
1,188
لایک ها
888
امتیاز
0
#14
پاسخ : اوراسیل و تیمین

گروه متیل پیوند هیدروژنی می دهد ؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟ نه خیر من این توضیح را برای این جمله گفتم که چرا وجود t پیوند فسفودی استر را در rna ناپایدار می کند !
اصلا حواسم نبود !! یه شکلی رو دیدم و گروه متیل a رو با t قاطی گرفتم !!!

حالا چرای دوم به جفت شدن باز ها بستگی دارد؟
 

Ardavan

Well-Known Member
ارسال ها
914
لایک ها
428
امتیاز
63
#15
پاسخ : اوراسیل و تیمین

اصلا حواسم نبود !! یه شکلی رو دیدم و گروه متیل a رو با t قاطی گرفتم !!!

حالا چرای دوم به جفت شدن باز ها بستگی دارد؟
چرای دوم را که ریحانه خانم جواب دادن ! فقط من این جمله را زیر سوال بردم تا سوال زیباتر بشه ! چرای سوم هم که کاملا واضحه !
الان روی این سوال من فکر کنید !!!!
 

Ardavan

Well-Known Member
ارسال ها
914
لایک ها
428
امتیاز
63
#16
پاسخ : اوراسیل و تیمین

الان این پاسخ یک ایرادی که داره و من همیشه اون را این طور جواب می دم اینه :
با امدن t در dna احتمال این نوع جهش دامیناسیون کم می شه اما بالعکس احتمال جهش های دیمر پیرییدینی افزایش می یابد . ( t بیش از سایر بازها تمایل به تشکیل دیمر در حضور پرتوفرابنفش دارد ) . حالا چه توضیحی می تواند توجیه کند که احتمال جهش با امدن t در dna پایین تر می اید ؟
الان کسی جواب این سوال را نمی ده ؟؟!!
 

Ibo_Dec

New Member
ارسال ها
1,568
لایک ها
1,062
امتیاز
0
#17
پاسخ : اوراسیل و تیمین

الان کسی جواب این سوال را نمی ده ؟؟!!
سلام.
چرا تصور مي كنيد كه فقط ما ديمرتيمين داريم ؟ ما يوراسيل دايمر هم داريم .
In dsRNA, uracil dimers may also accumulate as a result of UV radiation.

درضمن ديمرتيمين با انزيم Spore photoproduct lyase ترميم مي شود.

خب حالا فرض كنيد ما يوراسيل داشته باشيم كه هم دايمريوراسيل تشكيل مي دهد و هم درترميم نرخ جهش را بالا مي برد بهتر است يا تيمين داشته باشيم كه دايمر تيمين تشكيل مي دهد و ترميم مي شود و تازه درترميم نرخ جهش را به ميزان چشم گيري پايين مي اورد ؟ خب مسلما تيمين به نفع ما هست .

منبع : Spore photoproduct lyase - Wikipedia, the free encyclopedia
منبع : Pyrimidine dimer - Wikipedia, the free encyclopedia
 

Neuron

New Member
ارسال ها
78
لایک ها
68
امتیاز
0
#18
پاسخ : اوراسیل و تیمین

سلام.
چرا تصور مي كنيد كه فقط ما ديمرتيمين داريم ؟ ما يوراسيل دايمر هم داريم .
In dsRNA, uracil dimers may also accumulate as a result of UV radiation.

درضمن ديمرتيمين با انزيم Spore photoproduct lyase ترميم مي شود.

خب حالا فرض كنيد ما يوراسيل داشته باشيم كه هم دايمريوراسيل تشكيل مي دهد و هم درترميم نرخ جهش را بالا مي برد بهتر است يا تيمين داشته باشيم كه دايمر تيمين تشكيل مي دهد و ترميم مي شود و تازه درترميم نرخ جهش را به ميزان چشم گيري پايين مي اورد ؟ خب مسلما تيمين به نفع ما هست .

منبع : Spore photoproduct lyase - Wikipedia, the free encyclopedia
منبع : Pyrimidine dimer - Wikipedia, the free encyclopedia
اون آنزیم لیاز مخصوص باکتری هاست .
بله درسته که برای یوراسیل هم هست ولی نرخش برای تیمین بسیار بیش تره !!
 

Ibo_Dec

New Member
ارسال ها
1,568
لایک ها
1,062
امتیاز
0
#19
پاسخ : اوراسیل و تیمین

اون آنزیم لیاز مخصوص باکتری هاست .
بله درسته که برای یوراسیل هم هست ولی نرخش برای تیمین بسیار بیش تره !!
خب Spore photoproduct lyase براي باكتري ها هست اين راه ترميم را چه مي گوييد ؟ (البته برش هم يكي از راه ها مي باشد.)
most organisms (excluding placental mammals such as humans) they can be repaired by photoreactivation. Photoreactivation is a repair process in which photolyase enzymes directly reverse CPDs via photochemical reactions.

---- دو نوشته به هم متصل شده است ----

احتمالا هرچي كه هست بايد جواب در ميزان و قدرت ترميم دايمرتيمين باشد كه نسبت به جهش با يوراسيل بهينه باشد براي ماده ي ژنتيكي كه تيمين داشته باشد نه يوراسيل. درسته؟
 

Neuron

New Member
ارسال ها
78
لایک ها
68
امتیاز
0
#20
پاسخ : اوراسیل و تیمین

خب Spore photoproduct lyase براي باكتري ها هست اين راه ترميم را چه مي گوييد ؟ (البته برش هم يكي از راه ها مي باشد.)
most organisms (excluding placental mammals such as humans) they can be repaired by photoreactivation. Photoreactivation is a repair process in which photolyase enzymes directly reverse CPDs via photochemical reactions.

---- دو نوشته به هم متصل شده است ----

احتمالا هرچي كه هست بايد جواب در ميزان و قدرت ترميم دايمرتيمين باشد كه نسبت به جهش با يوراسيل بهينه باشد براي ماده ي ژنتيكي كه تيمين داشته باشد نه يوراسيل. درسته؟

این متن که نوشته تازه انسان و پستانداران جفت دار ندارند !!
بله درسته اون جملات آخر !!​
 
بالا