سوالی از جنس ریاضی و ترکیبیات ولی زیستی

[aftab75]

سلام.من این سوال رو توی اینترنت دیدم ولی جوابشو نمیدونم.ممنون میشم اگه پاسخش رو بدید

سوالی از جنس ریاضی و ترکیبیات ولی زیستی و بسیار جالب:
یکی از فرآیندهای مربوط به پروتئین ها دناتوره (Denature) شدن آن هاست.طی این فرآیند ساختمان طبیعی سه بعدی پروتئینی (Native) از بین می رود و دیگر پروتئین قادر به انجام عملش نخواهد بود. برخی پروتئین ها می توانند بعد از برداشتن عامل دناتوره کننده دوباره به حالت طبیعی برگردند که به این فرآیند رناتوراسیون می گویند.
در یک پروتئین فرضی که توانایی رناتوراسیون را داراست از مرکاپتواتانل برای احیا و شکستن پیوندهای دی سولفیدی استفاده شده و پروتئین را به حالت دناتوره در آورده است.
اگر در این پروتئین تنها 10 ریشه سیستئین برای ایجاد پیوندهای دی سولفید موجود باشند و پروتئین اولیه دارای 5 پیوند دی سولفیدی بوده است چقدر احتمال دارد تا در فرآیند رناتوراسیون، 5 پیوند اولیه دی سولفیدی دوباره به طور صحیح تشکیل شوند؟
(توجه داشته باشید که تمامی ریشه های سیستئین در پیوندهای دی سولفید شرکت می کنند و پیوند های دی سولفید خودبخود دوباره تشکیل می شوند)

 

[ali farshbaf]

پاسخ : سوالی از جنس ریاضی و ترکیبیات ولی زیستی

0.000033069

 

[aftab75]

پاسخ : سوالی از جنس ریاضی و ترکیبیات ولی زیستی

چه جوری؟راه حلش چی هست؟

 

[ali farshbaf]

پاسخ : سوالی از جنس ریاضی و ترکیبیات ولی زیستی

احتمال یک حالت از میان 10 فاکتوریل تقسیم بر 5فاکتوریل حالت.

 

[bioboy]

پاسخ : سوالی از جنس ریاضی و ترکیبیات ولی زیستی

يه تيكه تو لننيجر(اكه اشتباه نكم) هم يه مثالي مشابه اين زده...تعداد كل حالات براي ٥ تا دي سولفيد ميشه:٩*٧*٥*٣*١=٩٤٥....كه يه حالت از ٩٤٥ حالت ميشه:٠.٠٠١

 

[AnuBiS]

پاسخ : سوالی از جنس ریاضی و ترکیبیات ولی زیستی

به نظر منم یه جوریه جوابت آقای فرشباف.
آخه ما مگه ده تا ریشه سیستئین نداریم؟ پس یعنی در نهایت 5 تا پیوند می تونیم داشته باشیم دیگه! که یعنی اولی می تونه با 9 تا دیگه پیوند بده. پس یعنی الان 2 شاون پریدن. حالا بعدیه با 7 تای باقی مونده می تونه پیند بده و به همین ترتیب می ره جلو که همون 9*7*5*3*1 می شه داداش بیوبوی بالا گفته...
ولی یه نکته این وسط می مونه. اگه در یه حالتهایی دو تا با هم پیوند ندن چی؟مثلا دوتاشون فاصلهشون اونقدر بهم نزدیک باشه با هم نتونن پیوند بدن ولی با بقیه چرا. البته می دونم تو صورت سوال نیستا. ولی کلا... حالا نه به خاطر نزدیکی به هر دلیلی اگه نتونن با هم پیوند بدن چی؟

 

[zeinab-bio]

پاسخ : سوالی از جنس ریاضی و ترکیبیات ولی زیستی

تاپیک بیاد بالا...

 

[erfan54]

پاسخ : سوالی از جنس ریاضی و ترکیبیات ولی زیستی

از ۱۰ تا ریشه یمی رو انتخاب می کنیم، حالا به نظرتون احتمال این که با ریشه درست پیوند بده چقده؟! یک-نهم . پس تا الان ۲ تا ریشمون رفت! حالا یه ریشه دیگه رو انتخاب می کنیم، حالا این احتمال پیدا کردن ریشه درشتس چقده؟ یک-هفتم،چون دو تا که رفته بود و یکیه دیگه هم دارین pair ش رو انتخاب می کنیم به همین ترتیب داریم :

یک-نهم * یک-هفتم * یک-پنجم * یک- سوم =
0.001058

 

[zeinab-bio]

پاسخ : سوالی از جنس ریاضی و ترکیبیات ولی زیستی

از ۱۰ تا ریشه یمی رو انتخاب می کنیم، حالا به نظرتون احتمال این که با ریشه درست پیوند بده چقده؟! یک-نهم . پس تا الان ۲ تا ریشمون رفت! حالا یه ریشه دیگه رو انتخاب می کنیم، حالا این احتمال پیدا کردن ریشه درشتس چقده؟ یک-هفتم،چون دو تا که رفته بود و یکیه دیگه هم دارین pair ش رو انتخاب می کنیم به همین ترتیب داریم :

یک-نهم * یک-هفتم * یک-پنجم * یک- سوم =
0.001058

درسنه فک کنم،حواهشا خودتونم سوال بذارید...

 

[Ali Aminzadeh]

پاسخ : سوالی از جنس ریاضی و ترکیبیات ولی زیستی

سوال از ما |حتمال پرسیده . اگر هر سیستئین فقط بخواد با همون سیستئین قبلی پیوند برقرار کنه ، 1 سیستئین رو در نظر میگیریم اونوقت از 9 تای باقیمانده فقط یکی رو میخوایم پس میشه 1/9 . حالا 8 تا سیستئین باقی مونده ، به همین ترتیب احتمال میشه 1/7 . اگر همین روند رو ادامه بدیم احتمال اینکه پیوند های قبلی برقرار باشن به دست میاد .1* 1/3 * 1/5 * 1/7 * 1/9

945 حالت هست که ما فقط یکیش رو میخویم .

 

[zeinab-bio]

پاسخ : سوالی از جنس ریاضی و ترکیبیات ولی زیستی

سوال از ما |حتمال پرسیده . اگر هر سیستئین فقط بخواد با همون سیستئین قبلی پیوند برقرار کنه ، 1 سیستئین رو در نظر میگیریم اونوقت از 9 تای باقیمانده فقط یکی رو میخوایم پس میشه 1/9 . حالا 8 تا سیستئین باقی مونده ، به همین ترتیب احتمال میشه 1/7 . اگر همین روند رو ادامه بدیم احتمال اینکه پیوند های قبلی برقرار باشن به دست میاد .1* 1/3 * 1/5 * 1/7 * 1/9

945 حالت هست که ما فقط یکیش رو میخویم .

دوست عزیز همین بالا با همین روش حل شده بود!!!!

 

[Ibo_Dec]

پاسخ : سوالی از جنس ریاضی و ترکیبیات ولی زیستی

يه تيكه تو لننيجر(اكه اشتباه نكم) هم يه مثالي مشابه اين زده...تعداد كل حالات براي ٥ تا دي سولفيد ميشه:٩*٧*٥*٣*١=٩٤٥....كه يه حالت از ٩٤٥ حالت ميشه:٠.٠٠١

بله دقيقا .
فصل چهارم لنينجر. ريبونوكلئاز A كه داراي چهار پيوند دي سولفيدي و هشت باقي مانده ي Cys مي باشد كه تعداد حالات ممكن براي ايجاد چهار پيوند تصادفي دي سولفيدي از هشت باقي مانده سيستئين مي شود :

پس احتمال درست تشكيل شدنش مي شود :