پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

[Ardavan]

به نظر شما کدام یک از جانداران زیر در پروتیئن های خود تعداد پیوند دی سولفیدی کم تری دارد و چرا؟
الف) ارکیا ب) یوکاریوت های تک سلولی ج) باکتری ها

 

[Fallen]

پاسخ : پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

من میگم در حالت کلی آرکیا چون بعضی هاشون در محیط های شدیدا احیا کننده به سر میبرند
جدا از این چیزی به ذهنم نمیرسه !!

 

[Ardavan]

پاسخ : پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

من میگم در حالت کلی آرکیا چون بعضی هاشون در محیط های شدیدا احیا کننده به سر میبرند
جدا از این چیزی به ذهنم نمیرسه !!

درسته !!! در حالت کلی همین طوره ! این سوال خیلی ساده بود ! ظاهرا بچه ها هر موقع من تاپیک می زنم فکر می کنن جوابش خیلی سخته !
اما یک سوال قشنگ تر! حالا چرا این ها با وجود محیط حیاکننده بازم در پروتیئن هاشون پیوند دی سولفیدی پیدا می شه ؟

 

[Fallen]

پاسخ : پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

درسته !!! در حالت کلی همین طوره ! این سوال خیلی ساده بود ! ظاهرا بچه ها هر موقع من تاپیک می زنم فکر می کنن جوابش خیلی سخته !
اما یک سوال قشنگ تر! حالا چرا این ها با وجود محیط حیاکننده بازم در پروتیئن هاشون پیوند دی سولفیدی پیدا می شه ؟

آخه کلا سوالای تو سخته مگر خلافش ثابت شه :4: :4: :4: :4: :4:
دیگه حداقل تو غشا میشه برا پایداری بیشتر ساختار از دی سولفید استفاده کرد دیگه !!!

 

[Ardavan]

پاسخ : پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

آخه کلا سوالای تو سخته مگر خلافش ثابت شه :4: :4: :4: :4: :4:
دیگه حداقل تو غشا میشه برا پایداری بیشتر ساختار از دی سولفید استفاده کرد دیگه !!!

بازم سخت ترش می کنم !! ما میگیم که محیط داخل سلول احیاکنندس و برای همین پیوند دی سولفیدی معمولا تشکیل نمی شه ! حالا در بعضی ترموفیل ها به فراوانی حتی در پروتیئن های سیتوسولی یافت می شه !!!! ( یک استثنا برای این جمله ی قبلی خودم ) حالا سوال اینه که چگونه همچین چیزی ممکنه؟؟؟؟

 

[Fallen]

پاسخ : پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

بازم سخت ترش می کنم !! ما میگیم که محیط داخل سلول احیاکنندس و برای همین پیوند دی سولفیدی معمولا تشکیل نمی شه ! حالا در بعضی ترموفیل ها به فراوانی حتی در پروتیئن های سیتوسولی یافت می شه !!!! ( یک استثنا برای این جمله ی قبلی خودم ) حالا سوال اینه که چگونه همچین چیزی ممکنه؟؟؟؟

ترموفیل ها یه خرده در برقراری پیوند هیدروژنی مشکل دارن پیوند کووالان اینچنینی خیلی بدرد میخوره !!!!
بنابراین باید ممکن باشه وگرنه سلول پدرش درمیاد :4: :4:

 

[Ardavan]

پاسخ : پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

ترموفیل ها یه خرده در برقراری پیوند هیدروژنی مشکل دارن پیوند کووالان اینچنینی خیلی بدرد میخوره !!!!
بنابراین باید ممکن باشه وگرنه سلول پدرش درمیاد :4: :4:

وقتی پیوند داخل سلول احیا میشه چه جور ممکنه ؟؟؟؟؟

 

[Fallen]

پاسخ : پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

آهان شاید micro environment دور پیوند درست میکنه که خیلی هم احیا کننده نیست !!
برا سازگاری در برابر دما مجبوره !!

 

[Ardavan]

پاسخ : پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

آهان شاید micro environment دور پیوند درست میکنه که خیلی هم احیا کننده نیست !!
برا سازگاری در برابر دما مجبوره !!

می دونم مجبوره ! سوالم اینه که چه مکانیسم در این ها تکامل پیدا کرده تا با این مشکل مقابله کنن ؟ منظورت از micro environment چیه دقیقا ؟؟

 

[Fallen]

پاسخ : پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

ینی یه محیط کوچک که با محیط کلی متفاوته !!! مثلا میتونه پیوند رو داخل سلول دفن کنه یا حداقل در سطح نباشه

 

[Ardavan]

پاسخ : پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

ینی یه محیط کوچک که با محیط کلی متفاوته !!! مثلا میتونه پیوند رو داخل سلول دفن کنه یا حداقل در سطح نباشه

نمی فهمم منظورت چیه !!!! اخه داخل هم داخل سلول شدیدا احیاکنندس هم خارج سلول !! مگه جسده که دفنش کنه :4:

 

[Fallen]

پاسخ : پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

بابا منظورم در اعماق پروتئین قرارش بده اصطلاحا به این حرکت میگن دفن کردن !!! :4: :4:

 

[Ardavan]

پاسخ : پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

بابا منظورم در اعماق پروتئین قرارش بده اصطلاحا به این حرکت میگن دفن کردن !!! :4: :4:

پیوند دی سولفیدی اکثرا در داخل پروتیئن تشکیل می شه ( به قوا تو دفن میشه :4 اما توی یوکاریوت ها این پیوند احیا میشه (معمولا) اما توی ارکیا نمیشه !!

 

[Masoud-s]

پاسخ : پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

تو اركي ها(اكثرا ترموفيل ها) به دليل تشكيل راديكال ازاد زياد،معمولا پتانسيل احيا كافي براي احياي دي سولفيد وجود نداره!پتانسيل احيا مصرف ميشه!

 

[Ardavan]

پاسخ : پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

تو اركي ها(اكثرا ترموفيل ها) به دليل تشكيل راديكال ازاد زياد،معمولا پتانسيل احيا كافي براي احياي دي سولفيد وجود نداره!پتانسيل احيا مصرف ميشه!

الان این جمله ی تو که کل سوال منا نقض کرد که!!! پس می گی تو ارکیا تازه بیش تر پیوند دی سولفیدی داریم ؟؟؟ (غیر از ترموفیل ها بقیه هم خیلی در معرض رادیکال ازادن!)

 

[Wight]

پاسخ : پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

به نظر شما کدام یک از جانداران زیر در پروتیئن های خود تعداد پیوند دی سولفیدی کم تری دارد و چرا؟
الف) ارکیا ب) یوکاریوت های تک سلولی ج) باکتری ها

فکر کنم یوکاریوت ها از همه کمتر باشه چون درون سلول محیطش خیلی احیا ست!!!!

ارکیا فکر کنم از همه بیشتر چون در درجه حرارت بالا زندگی میکنه (و البته باکتری های حرارت دوست)

 

[Ardavan]

پاسخ : پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

فکر کنم یوکاریوت ها از همه کمتر باشه چون درون سلول محیطش خیلی احیا ست!!!!

ارکیا فکر کنم از همه بیشتر چون در درجه حرارت بالا زندگی میکنه (و البته باکتری های حرارت دوست)

جواب سوال ارکیاست (به نقل از ویکی پدیا) !! ( البته اگر ترموفیل ها و استثنائات خاص را در نظر نگیریم ) ولی انگار یک تناقضی این وسط پیش اومده !! الان گفته مسعود به نظرم درست است و نباید جواب سوال ارکیا باشد !!

 

[Wight]

پاسخ : پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

جواب سوال ارکیاست (به نقل از ویکی پدیا) !! ( البته اگر ترموفیل ها و استثنائات خاص را در نظر نگیریم ) ولی انگار یک تناقضی این وسط پیش اومده !! الان گفته مسعود به نظرم درست است و نباید جواب سوال ارکیا باشد !!

خب الان جواب من چه اشکالی داره !

 

[Ardavan]

پاسخ : پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

خب الان جواب من چه اشکالی داره !

علم را نقض می کنه !!!! البته اون جمله اول هم درست به نظر می یاد ( پتانسیل احیا در یوکاریوت ها بیش تر) .
ولی همه ی ارکیا در درجه حرارت های بالا زندگی نمی کنن . کلا ترموفیل ها را در نظر نگیر !(اونا شرایطشون جداست)
Reconsideration of an early dogma, saying “there is no evidence for disulfide bonds in proteins from archaea” - Springer
این منبعی که می گه تعدا پیوند دی سولفیدی در این جانداران معمولا کم تر از بقیه است !
[MENTION=13373]Masoud-s[/MENTION] الان از حرف خودت دفاع کن !

 

[Masoud-s]

پاسخ : پیوند دی سولفیدی در پروتیئن ها

ذفاعی ندارم صرفا چیری بود که به ذهنم رسید........