عوامل واسرشت (Denaturation) پروتئین
پاسخ : عوامل واسرشت (Denaturation) پروتئین
هرکس با شماره نشان بده
گاهی تغییر شدید ph میتونه پروتئین را دناتوره کنه.
خب نظر دیگه ای ندارین؟
هرکس با شماره نشان بده
1:تغییر ph
تغییر ph باعث یونیزاسیون اسید آمینه های باردار میشه درنتیجه بار های مجاور پروتئین ها تغییر میکنه و در نتیجه ممکنه یک تغییر کونفورماسیونی رخ بده و عملکرد پروتئین تغییر کنه.گاهی تغییر شدید ph میتونه پروتئین را دناتوره کنه.
خب نظر دیگه ای ندارین؟
پاسخ : عوامل واسرشت (Denaturation) پروتئین
خب این در مورد یک اسید آمینه است. در مورد کل پروتئین ph ایزوالکتریک زمانی است که کلا پروتئین خنثی باشد. که این لزوما به این معنا نیست تمام اسید آمینه ها در PI باشند.
الکتروفورز که بر این اساس ایجاد میشه:
یک شیب باردار ایجاد میکنند و بعد پروتئین براساس باری که دارد در یک نقطه می ایستد و آن نقطه اطلاعات ph مخصوص خود را دارد. پس میفهمند پروتئین در چه وضعیتی بوده...
خب این در مورد یک اسید آمینه است. در مورد کل پروتئین ph ایزوالکتریک زمانی است که کلا پروتئین خنثی باشد. که این لزوما به این معنا نیست تمام اسید آمینه ها در PI باشند.
الکتروفورز که بر این اساس ایجاد میشه:
یک شیب باردار ایجاد میکنند و بعد پروتئین براساس باری که دارد در یک نقطه می ایستد و آن نقطه اطلاعات ph مخصوص خود را دارد. پس میفهمند پروتئین در چه وضعیتی بوده...
پاسخ : عوامل واسرشت (Denaturation) پروتئین
در الکتروفورز ایزو الکتریک :
در واقع اگه pH کمتر از pI باشه بار خالص پروتئین مثبت میشه ( بدلیل پروتونه شدن ) و به طرف الکترود منفی حرکت میکنه
اگه pH بیشتر از pI باشه بدلیل دپروتونه شدن بار خالص منفی میشه و به طرف الکترود مثبت حرکت میکنه
در ضمن در ژل آکریل آمید یک شیب pH داریم و بار پروتئین طی حرکت کم میشه ( منظورم اینه که چه بار مثبت و چه منفی کم میشه به صفر نزدیک میشه ) تا زمانی که به منطقه ای از ژل برسه که pH اون با pI پروتئین برابره . در اینجا چون بار خالص پروتئین صفره دیگه حرکت نمیکنه .
خوب بود استاد ؟
در الکتروفورز ایزو الکتریک :
در واقع اگه pH کمتر از pI باشه بار خالص پروتئین مثبت میشه ( بدلیل پروتونه شدن ) و به طرف الکترود منفی حرکت میکنه
اگه pH بیشتر از pI باشه بدلیل دپروتونه شدن بار خالص منفی میشه و به طرف الکترود مثبت حرکت میکنه
در ضمن در ژل آکریل آمید یک شیب pH داریم و بار پروتئین طی حرکت کم میشه ( منظورم اینه که چه بار مثبت و چه منفی کم میشه به صفر نزدیک میشه ) تا زمانی که به منطقه ای از ژل برسه که pH اون با pI پروتئین برابره . در اینجا چون بار خالص پروتئین صفره دیگه حرکت نمیکنه .
خوب بود استاد ؟
آخرین ویرایش توسط مدیر
پاسخ : عوامل واسرشت (Denaturation) پروتئین
با تشکر از راماز عزیز. در مورد دما نکاتی که به ذهنم میرسه:
1- دما در ناتوراسیون و یا دناتوراسیون پروتئین یک نمودار s مانند ایجاد میکنه که نقطه میانی اش که نصف پیوند های هیدروژنی از بین رفته احتمالا با Tm نشان میدهند(مثل هیبریداسیون dna).
2- فکر کنم دما روی سایر میانکنش ها از جمله میانکنش های الکترواستاتیک هم نقش داشته باشه ولی درست نمیدونم.
3- کلا دما عامل زیاد قوی نیست برای دناتوره کردن پروتئین. تغییر ph و یا یار الکتریکی اطراف پروتئین قوی تر است.
با تشکر از راماز عزیز. در مورد دما نکاتی که به ذهنم میرسه:
1- دما در ناتوراسیون و یا دناتوراسیون پروتئین یک نمودار s مانند ایجاد میکنه که نقطه میانی اش که نصف پیوند های هیدروژنی از بین رفته احتمالا با Tm نشان میدهند(مثل هیبریداسیون dna).
2- فکر کنم دما روی سایر میانکنش ها از جمله میانکنش های الکترواستاتیک هم نقش داشته باشه ولی درست نمیدونم.
3- کلا دما عامل زیاد قوی نیست برای دناتوره کردن پروتئین. تغییر ph و یا یار الکتریکی اطراف پروتئین قوی تر است.
پاسخ : عوامل واسرشت (Denaturation) پروتئین
2-گرمای بیش از حد
برای نمونه گرمای بیش از حد بدن سبب واسرشتن پروتئین شده و فسفولیپیدها، لیپوپروتئین‌ها و لیپیدهای محلول در آب غشای سلول‌ها را بی ثبات نموده، منجر به کولاپس قلبی میشود
پاسخ : عوامل واسرشت (Denaturation) پروتئین
با اجازه استاد
کلا ناتوراسیون و یا دناتوراسیون یک سوپر مولکول فضایی- مثل dna و پروتئین- یک فرایند cooperative(تعاونی) است.
فرایند تعاونی یعنی دو حالت دارد.(two state) یا پروتئین کامل و یا باز شده.
Tm هم دمایی که در آن نصف ساختار پروتئین باز شده(یا بسته شده). توی یکی از بحث هایی که داشتیم نهایتا به این نتیجه رسیدیم که منظور از جمله قبل یعنی نصف پیوندهای هیدروژنی باز شده یا بسته مانده است.
نمودار این فرایند S مانند است(سیگموئید و یا الگوی رشد لجستیک).
به زبان ساده تر شما نمیتونید پروتئین را میان دو حالت ناتوره و یا دناتوره ببینید.
فرض کنیم یه پروتئین کامل داریم. دما را زیاد میکنیم. ابتدا بخاطر ساختمان مولکولی، پروتئین کمی مقاومت نشان میدهد. ولی از زمانی که اولین پیوند هیدروژنی شکسته میشود پروتئین وارد حالت دناتوراسیون میشود.
از حالا به بعد هر پیوند هیدروژنی که باز میشود به باز شدن بعدی کمک میکند(تعاون میکند). بنابراین بر فرض مثال در ثانیه اول 1 پیوند، در ثانیه دوم 3 پیوند، بعد 5 پیوند و همینطور با یک الگوی رشد تقریبا نمایی بالا میرود.
پس در یک محلول شما نمیتوانید پروتئینی را پیدا کنید که مثلا در Tm قرار گرفته. مگر اینکه تکنولوژِی خیلی پیشرفت کند.
با اجازه استاد
کلا ناتوراسیون و یا دناتوراسیون یک سوپر مولکول فضایی- مثل dna و پروتئین- یک فرایند cooperative(تعاونی) است.
فرایند تعاونی یعنی دو حالت دارد.(two state) یا پروتئین کامل و یا باز شده.
Tm هم دمایی که در آن نصف ساختار پروتئین باز شده(یا بسته شده). توی یکی از بحث هایی که داشتیم نهایتا به این نتیجه رسیدیم که منظور از جمله قبل یعنی نصف پیوندهای هیدروژنی باز شده یا بسته مانده است.
نمودار این فرایند S مانند است(سیگموئید و یا الگوی رشد لجستیک).
به زبان ساده تر شما نمیتونید پروتئین را میان دو حالت ناتوره و یا دناتوره ببینید.
فرض کنیم یه پروتئین کامل داریم. دما را زیاد میکنیم. ابتدا بخاطر ساختمان مولکولی، پروتئین کمی مقاومت نشان میدهد. ولی از زمانی که اولین پیوند هیدروژنی شکسته میشود پروتئین وارد حالت دناتوراسیون میشود.
از حالا به بعد هر پیوند هیدروژنی که باز میشود به باز شدن بعدی کمک میکند(تعاون میکند). بنابراین بر فرض مثال در ثانیه اول 1 پیوند، در ثانیه دوم 3 پیوند، بعد 5 پیوند و همینطور با یک الگوی رشد تقریبا نمایی بالا میرود.
پس در یک محلول شما نمیتوانید پروتئینی را پیدا کنید که مثلا در Tm قرار گرفته. مگر اینکه تکنولوژِی خیلی پیشرفت کند.
